后来有人考证，拿破仑在上岛之前就得了一种热带病，因为拿破仑曾于1798年对埃及、叙利亚和利比亚进行了几次远征，应该在此染了病。当他被流放到圣赫勒拿岛时，潮湿的环境引发了旧病，最终导致他的死亡。还有人认为，法国国王路易十八的弟弟阿图瓦伯爵（就是后来的查理十世）忌惮拿破仑，他指使人给他下了一种不知名的慢性毒药，导致拿破仑毒发身亡。然而，这些推测出的死因没有找到足够的证据，真相仍是扑朔迷离。
到了20世纪50年代，质疑忽然有了新的论据。
瑞典牙医斯坦·福舒夫伍德业余喜欢钻研生物和病毒学，对拿破仑的死因很感兴趣。在1955年的一天夜晚，他在家阅读拿破仑的内侍长路易·马尔尚的回忆录，里面详细记载了拿破仑生命最后4个月的状况。其中有对处于生命最后阶段的拿破仑的痛苦描写——牙根暴露，腿部发肿，而且睡眠极差——引起了福舒夫伍德的注意。根据他多年研究病毒学的经验，这与砷中毒的症状非常相似。砷就是砒霜的主要成分，是一种没有刺激性、无味、很容易溶于水和食物的剧毒物质。而且根据他查阅的资料，在18世纪的欧洲，用砷下毒是非常普遍的作案手段。如果把砷和吐酒石、甘汞合用，会使中毒者的症状和其他病症非常相似，即使剖尸检查，也很难找到砷中毒的证据。还有就是，慢性砷中毒而死的人，尸体腐烂的速度要比常人慢得多。1840年，拿破仑的遗体在被运回法国时，人们打开棺材，发现拿破仑的脸色跟当年下葬时一样，几乎没有变化。